Caracterización genómica del SARS-CoV-2, Norte de Santander-Colombia, 2020-2021

Heiddy Vargas, Clara Zambrano

Resumen


DOI: https://doi.org/10.53766/EHI/2023.09.02.02

Introducción: la pandemia de COVID-19, ha conllevado a que los países diseñen e implementen estrategias de caracterización genómica, que permitan identificar rápidamente las variantes o linajes circulantes en cada región. Objetivo: aplicar la estrategia de caracterización genómica para detectar y monitorear la circulación de variantes, linajes y mutaciones del SARS-CoV-2 en el Norte de Santander, durante el periodo noviembre 2020 a marzo 2021. Metodología: siguiendo la metodología de la Organización Mundial de la Salud (OMS) para la secuenciación genómica, se seleccionaron 283 muestras de hisopado de secreción nasal, de pacientes con sintomatología COVID-19 con resultado positivo a la prueba de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR); priorizando 73, de acuerdo al protocolo de depuración implementado. Posteriormente, el Instituto Nacional de Salud (INS) realizó el análisis bioinformático a 3 muestras que reunieron todos los requisitos de volumen, transporte, identificación de las mismas y cumplimiento de los criterios establecidos. Seguidamente, se ejecutó el proceso de gestión, publicación e interpretación de los datos, por parte del INS en la página web, en infografías y retroalimentación a la entidad territorial con el informe técnico. Resultados: se logró identificar en una de las muestras la variante preocupante Alpha del linaje B.1.1.7, con las mutaciones N501Y y P681H. Conclusión: la estrategia de caracterización genómica del SARS-CoV-2 arrojó información importante y debe convertirse en un componente básico del sistema de vigilancia epidemiológica.
Palabras clave: COVID-19, caracterización genómica, SARS-CoV-2 Colombia, PCR, migrantes.

Recibido: 31/3/2022
Aceptado: 23/8/2022
Publicado en línea: 05/05/2023


Palabras clave


COVID-19; caracterización genómica; SARS-CoV-2 Colombia, PCR; migrantes

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ISSN ELECTRÓNICO: 2542-3444

DOI: https://doi.org/10.53766/EHI

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