Análisis comparativo de metodologías para aislar material genético en muestras fecales humanas
Comparative analysis of methodologies for isolating genetic material in human fecal sam-ples

Freddy Alexander Guano Carrasco, Martha Cecilia Ramos Ramírez, Cristian Fernando Galarza Galarza

Resumen


RESUMEN
El aislamiento de material genético a partir de muestras fecales humanas es un proceso esencial en los estudios del microbioma intestinal, el diagnóstico molecular y la investiga-ción biomédica. Esta revisión bibliográfica recopila y analiza comparativamente diferentes metodologías de extracción de ADN utilizadas entre 2020 y 2025, considerando el rendi-miento, la pureza, la eliminación de inhibidores, el tiempo de procesamiento y la reproduci-bilidad. Se revisaron protocolos tradicionales basados en fenol-cloroformo y kits comercia-les como QIAamp PowerFecal Pro DNA Kit, DNeasy PowerSoil Pro Kit, NucleoSpin DNA Stool Kit, entre otros. Los resultados indican que los kits comerciales actuales superan am-pliamente a los métodos convencionales en eficiencia, seguridad y calidad del ADN obteni-do, eliminando la necesidad de pasos mecánicos complejos y solventes tóxicos. Además, se evidencia la importancia de la estandarización de protocolos y controles de calidad en la extracción de ADN fecal para asegurar la comparabilidad entre estudios y laboratorios. Esta revisión destaca la relevancia de optimizar los procedimientos de laboratorio clínico y de investigación molecular, con impacto directo en el diagnóstico y en la comprensión del mi-crobioma humano.

ABSTRACT
The isolation of genetic material from human fecal samples is a crucial step in intestinal microbiome studies, molecular diagnostics, and biomedical research. This bibliographic review comparatively analyzes different DNA extraction methodologies published between 2020 and 2025, focusing on yield, purity, inhibitor removal, processing time, and reproduci-bility. Traditional phenol-chloroform methods and commercial kits such as QIAamp Power-Fecal Pro DNA Kit, DNeasy PowerSoil Pro Kit, and NucleoSpin DNA Stool Kit were evalu-ated. Findings reveal that modern commercial kits outperform conventional methods in effi-ciency, safety, and DNA quality, eliminating the need for toxic reagents and complex me-chanical disruption. Furthermore, the standardization of extraction protocols and quality controls is essential to ensure inter-laboratory reproducibility. This review underscores the importance of improving laboratory and molecular research procedures to enhance diagnos-tic accuracy and deepen understanding of the human microbiome.

Recibido: 10-10-2025
Aprobado: 18-12-2025
Publicado: 02-02-2026


Palabras clave


extracción de ADN; inhibidores de PCR; métodos comparativos; microbioma intestinal; muestras fecales. DNA extraction; PCR inhibitors; comparative methods; intestinal microbiome; fecal sam-ples.

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