Métodos robustos de normalización de microarreglos de ADNc basados en la mediana

José L. Paredes Q., Juan Marcos Ramírez Rondón, Giorgio Alessandro Bianchi Donayre

Resumen


En este trabajo se presentan dos nuevos métodos de normalización de datos microarreglos de ADNc basados en el operador de mediana ponderada. El primer método estima el parámetro de normalización usando regresión por desviación absoluta mínima. Tal método asume que las variaciones entre los datos generados por repeticiones del mismo experimento tienen características impulsivas, y por tanto pueden ser modeladas por distribuciones de tipo Laplaciano. El segundo método incorpora robustez a un procedimiento de normalización previamente reportado sustituyendo la correlación tradicional por la correlación basada en mediana. El desempeño de los dos métodos propuestos es comparado con métodos similares reportados en la literatura. Las medidas de desempeño usadas son el error medio cuadrático y el error medio absoluto entre el conjunto de datos de referencia y el conjunto de datos normalizados. Además se evalúa la variación de los datos normalizados usando gráficos de cuartiles.


Palabras clave


Microarreglos; Normalización; Mediana ponderada; Microarray; Normalization; Weighted median

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